燃料电池控制器是燃料电池系统的控制中枢，具有三项主要功能，一是启动燃料电池系统、二是确保系统稳定运转、三是关闭燃料电池系统。燃料电池控制器根据外部负载功率需求执行阳极次系统控制策略、阴极次系统控制策略、热管理控制策略，并且持续实时监控系统运转状态，确保系统操作的稳定与安全。 APT之燃料电池控制器具备可靠、稳定、精密控制三大特点，可精准进行流体控制，维持燃料电池系统稳定运转，增进燃料电池效能与寿命。
APT燃料电池控制器具备有以下特性：
- 高速运算能力:采用32位DSP高速处理器，内建高分辨率ADC与快速PWM输出。
- 精密模拟运算设计:精准高速撷取传感器讯号，可实时获取系统操作状态进行控制策略运算。
- 远程通信技术:燃料电池系统参数远程数据搜集并进行诊断。
- 自动运转监控系统:具备系统异常预测与智能除错功能。
- 电磁兼容设计:可避免电磁干扰，进而提高产品可靠度。
- 隔离型通讯界面(Isolated Communications interfaces): CAN 2.0, RS485, RS232
